Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RarbP22605 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RarbP22605 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RarbP22605 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RarbP22605 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RarbP22605 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RarbP22605 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RarbP22605 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RarbP22605 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RarbP22605 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RarbP22605 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RarbP22605 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RarbP22605 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RarbP22605 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RarbP22605 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RarbP22605 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RarbP22605 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RarbP22605 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RarbP22605 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RarbP22605 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RarbP22605 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RarbP22605 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RarbP22605 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RarbP22605 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RarbP22605 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RarbP22605 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RarbP22605 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RarbP22605 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RarbP22605 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RarbP22605 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RarbP22605 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RarbP22605 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RarbP22605 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RarbP22605 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RarbP22605 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RarbP22605 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RarbP22605 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RarbP22605 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RarbP22605 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RarbP22605 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RarbP22605 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RarbP22605 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RarbP22605 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RarbP22605 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RarbP22605 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RarbP22605 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RarbP22605 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RarbP22605 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RarbP22605 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RarbP22605 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RarbP22605 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RarbP22605 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RarbP22605 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RarbP22605 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RarbP22605 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RarbP22605 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RarbP22605 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RarbP22605 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RarbP22605 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RarbP22605 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RarbP22605 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RarbP22605 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RarbP22605 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RarbP22605 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RarbP22605 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RarbP22605 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RarbP22605 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RarbP22605 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RarbP22605 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RarbP22605 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RarbP22605 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RarbP22605 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RarbP22605 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RarbP22605 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RarbP22605 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RarbP22605 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RarbP22605 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RarbP22605 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RarbP22605 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RarbP22605 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RarbP22605 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RarbP22605 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RarbP22605 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RarbP22605 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RarbP22605 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RarbP22605 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RarbP22605 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RarbP22605 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RarbP22605 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RarbP22605 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RarbP22605 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RarbP22605 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RarbP22605 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RarbP22605 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RarbP22605 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RarbP22605 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RarbP22605 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RarbP22605 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RarbP22605 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RarbP22605 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms