Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tap1P21958 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tap1P21958 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tap1P21958 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms