Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpcP21841 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpcP21841 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpcP21841 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpcP21841 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpcP21841 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpcP21841 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpcP21841 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpcP21841 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms