Protein–RNA interactions for Protein: P21440

Abcb4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb4P21440 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcb4P21440 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcb4P21440 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcb4P21440 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcb4P21440 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcb4P21440 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcb4P21440 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcb4P21440 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcb4P21440 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcb4P21440 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcb4P21440 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcb4P21440 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcb4P21440 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcb4P21440 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcb4P21440 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcb4P21440 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcb4P21440 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcb4P21440 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcb4P21440 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcb4P21440 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcb4P21440 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcb4P21440 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcb4P21440 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcb4P21440 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcb4P21440 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcb4P21440 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcb4P21440 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcb4P21440 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb4P21440 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms