Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Klra1P20937 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klra1P20937 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klra1P20937 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klra1P20937 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Klra1P20937 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klra1P20937 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms