Protein–RNA interactions for Protein: P20826

Kitlg, Kit ligand, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KitlgP20826 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KitlgP20826 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KitlgP20826 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KitlgP20826 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
KitlgP20826 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KitlgP20826 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KitlgP20826 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
KitlgP20826 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
KitlgP20826 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KitlgP20826 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KitlgP20826 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KitlgP20826 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KitlgP20826 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KitlgP20826 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KitlgP20826 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KitlgP20826 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KitlgP20826 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KitlgP20826 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
KitlgP20826 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms