Protein–RNA interactions for Protein: P20443

Sag, S-arrestin, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SagP20443 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SagP20443 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SagP20443 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SagP20443 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SagP20443 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SagP20443 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SagP20443 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SagP20443 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SagP20443 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SagP20443 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SagP20443 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SagP20443 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SagP20443 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SagP20443 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SagP20443 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SagP20443 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SagP20443 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SagP20443 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SagP20443 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SagP20443 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SagP20443 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SagP20443 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SagP20443 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SagP20443 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SagP20443 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SagP20443 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SagP20443 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SagP20443 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SagP20443 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SagP20443 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SagP20443 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SagP20443 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SagP20443 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SagP20443 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SagP20443 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SagP20443 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SagP20443 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SagP20443 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SagP20443 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SagP20443 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SagP20443 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SagP20443 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SagP20443 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SagP20443 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SagP20443 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SagP20443 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SagP20443 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SagP20443 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SagP20443 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SagP20443 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SagP20443 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SagP20443 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SagP20443 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SagP20443 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SagP20443 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SagP20443 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SagP20443 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SagP20443 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SagP20443 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SagP20443 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SagP20443 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SagP20443 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SagP20443 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SagP20443 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SagP20443 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SagP20443 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SagP20443 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SagP20443 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SagP20443 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SagP20443 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SagP20443 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SagP20443 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SagP20443 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SagP20443 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SagP20443 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SagP20443 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SagP20443 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SagP20443 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SagP20443 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SagP20443 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SagP20443 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SagP20443 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SagP20443 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SagP20443 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SagP20443 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SagP20443 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SagP20443 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SagP20443 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SagP20443 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SagP20443 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SagP20443 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SagP20443 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SagP20443 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SagP20443 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SagP20443 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SagP20443 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SagP20443 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SagP20443 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SagP20443 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SagP20443 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms