Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ntf3P20181 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms