Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P20040 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P20040 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P20040 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P20040 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P20040 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P20040 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P20040 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P20040 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P20040 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P20040 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P20040 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P20040 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P20040 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P20040 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P20040 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P20040 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P20040 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P20040 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P20040 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P20040 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P20040 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P20040 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P20040 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P20040 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P20040 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P20040 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P20040 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P20040 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P20040 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P20040 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P20040 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P20040 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P20040 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P20040 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P20040 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P20040 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P20040 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P20040 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P20040 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P20040 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P20040 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P20040 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P20040 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P20040 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P20040 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P20040 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P20040 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P20040 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P20040 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P20040 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P20040 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P20040 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P20040 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P20040 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P20040 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P20040 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P20040 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P20040 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P20040 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P20040 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P20040 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P20040 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P20040 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P20040 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P20040 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P20040 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P20040 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P20040 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P20040 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P20040 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P20040 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P20040 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P20040 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P20040 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P20040 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P20040 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P20040 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P20040 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P20040 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P20040 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P20040 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P20040 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P20040 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P20040 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P20040 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P20040 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P20040 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P20040 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P20040 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P20040 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
P20040 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P20040 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P20040 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
P20040 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P20040 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P20040 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P20040 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
P20040 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P20040 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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