Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms