Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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