Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RargP18911 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RargP18911 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RargP18911 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RargP18911 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RargP18911 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RargP18911 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RargP18911 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RargP18911 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RargP18911 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RargP18911 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RargP18911 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RargP18911 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RargP18911 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RargP18911 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RargP18911 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RargP18911 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RargP18911 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RargP18911 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RargP18911 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RargP18911 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RargP18911 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RargP18911 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RargP18911 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RargP18911 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RargP18911 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RargP18911 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RargP18911 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RargP18911 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RargP18911 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RargP18911 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RargP18911 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RargP18911 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RargP18911 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RargP18911 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RargP18911 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RargP18911 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RargP18911 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RargP18911 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RargP18911 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RargP18911 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RargP18911 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RargP18911 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RargP18911 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RargP18911 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RargP18911 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RargP18911 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RargP18911 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RargP18911 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RargP18911 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RargP18911 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RargP18911 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RargP18911 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RargP18911 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RargP18911 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RargP18911 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RargP18911 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RargP18911 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RargP18911 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RargP18911 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RargP18911 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RargP18911 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RargP18911 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RargP18911 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RargP18911 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RargP18911 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RargP18911 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RargP18911 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RargP18911 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RargP18911 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RargP18911 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RargP18911 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RargP18911 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RargP18911 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RargP18911 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RargP18911 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RargP18911 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RargP18911 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RargP18911 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RargP18911 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RargP18911 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RargP18911 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RargP18911 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RargP18911 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RargP18911 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RargP18911 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RargP18911 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RargP18911 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RargP18911 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RargP18911 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
RargP18911 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RargP18911 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RargP18911 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RargP18911 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RargP18911 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RargP18911 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RargP18911 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RargP18911 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RargP18911 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RargP18911 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms