Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18533 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18533 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18533 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18533 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18533 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18533 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18533 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18533 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18533 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18533 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18533 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18533 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18533 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18533 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18533 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P18533 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18533 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18533 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18533 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18533 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18533 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18533 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18533 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18533 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18533 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18533 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18533 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18533 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18533 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18533 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18533 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18533 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18533 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P18533 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18533 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18533 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18533 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18533 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18533 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18533 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18533 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18533 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18533 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18533 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18533 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18533 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18533 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18533 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18533 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18533 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18533 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18533 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18533 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P18533 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P18533 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P18533 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18533 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P18533 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18533 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18533 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18533 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18533 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18533 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18533 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18533 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P18533 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18533 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18533 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18533 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18533 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18533 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18533 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18533 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18533 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18533 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18533 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18533 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18533 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P18533 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18533 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18533 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18533 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P18533 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P18533 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18533 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18533 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18533 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18533 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18533 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18533 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18533 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18533 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18533 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18533 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18533 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18533 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18533 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18533 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18533 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms