Protein–RNA interactions for Protein: P18406

Cyr61, Protein CYR61, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyr61P18406 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyr61P18406 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms