Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmga1P17095 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmga1P17095 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmga1P17095 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmga1P17095 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmga1P17095 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmga1P17095 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmga1P17095 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmga1P17095 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmga1P17095 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmga1P17095 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmga1P17095 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmga1P17095 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmga1P17095 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmga1P17095 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmga1P17095 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmga1P17095 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmga1P17095 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmga1P17095 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmga1P17095 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmga1P17095 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmga1P17095 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmga1P17095 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmga1P17095 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmga1P17095 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmga1P17095 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmga1P17095 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmga1P17095 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmga1P17095 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmga1P17095 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmga1P17095 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmga1P17095 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmga1P17095 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmga1P17095 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmga1P17095 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hmga1P17095 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hmga1P17095 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmga1P17095 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms