Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ass1P16460 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ass1P16460 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ass1P16460 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ass1P16460 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ass1P16460 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ass1P16460 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ass1P16460 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms