Protein–RNA interactions for Protein: P14869

Rplp0, 60S acidic ribosomal protein P0, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp0P14869 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms