Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dnmt1P13864 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dnmt1P13864 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Dnmt1P13864 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dnmt1P13864 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms