Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrgnP13609 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrgnP13609 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SrgnP13609 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SrgnP13609 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrgnP13609 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SrgnP13609 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrgnP13609 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrgnP13609 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrgnP13609 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrgnP13609 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms