Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms