Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms