Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb1P12658 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb1P12658 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb1P12658 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb1P12658 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Calb1P12658 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Calb1P12658 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms