Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms