Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms