Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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