Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem254bP0DN90 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem254bP0DN90 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms