Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NefmP08553 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NefmP08553 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NefmP08553 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NefmP08553 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NefmP08553 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NefmP08553 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NefmP08553 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NefmP08553 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NefmP08553 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NefmP08553 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NefmP08553 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NefmP08553 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NefmP08553 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NefmP08553 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NefmP08553 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NefmP08553 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NefmP08553 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NefmP08553 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NefmP08553 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NefmP08553 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NefmP08553 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NefmP08553 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NefmP08553 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NefmP08553 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NefmP08553 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NefmP08553 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NefmP08553 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NefmP08553 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NefmP08553 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NefmP08553 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NefmP08553 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NefmP08553 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NefmP08553 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NefmP08553 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NefmP08553 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NefmP08553 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NefmP08553 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NefmP08553 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NefmP08553 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NefmP08553 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NefmP08553 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NefmP08553 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NefmP08553 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NefmP08553 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NefmP08553 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NefmP08553 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NefmP08553 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NefmP08553 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NefmP08553 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NefmP08553 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NefmP08553 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NefmP08553 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NefmP08553 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NefmP08553 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NefmP08553 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NefmP08553 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NefmP08553 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NefmP08553 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NefmP08553 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NefmP08553 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NefmP08553 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NefmP08553 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NefmP08553 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NefmP08553 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NefmP08553 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NefmP08553 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NefmP08553 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NefmP08553 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NefmP08553 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NefmP08553 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NefmP08553 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NefmP08553 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NefmP08553 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NefmP08553 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NefmP08553 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NefmP08553 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NefmP08553 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NefmP08553 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NefmP08553 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NefmP08553 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NefmP08553 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NefmP08553 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NefmP08553 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NefmP08553 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NefmP08553 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NefmP08553 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NefmP08553 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NefmP08553 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NefmP08553 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NefmP08553 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NefmP08553 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NefmP08553 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NefmP08553 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NefmP08553 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NefmP08553 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NefmP08553 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NefmP08553 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NefmP08553 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NefmP08553 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms