Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06321 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06321 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06321 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06321 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06321 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06321 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06321 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06321 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06321 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06321 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06321 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06321 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06321 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06321 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06321 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P06321 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06321 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06321 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06321 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06321 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06321 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06321 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P06321 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06321 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06321 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06321 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06321 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06321 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06321 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06321 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06321 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06321 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06321 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06321 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06321 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06321 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06321 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P06321 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06321 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P06321 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06321 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06321 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P06321 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06321 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06321 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06321 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06321 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06321 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06321 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06321 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06321 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06321 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06321 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06321 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06321 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06321 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06321 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06321 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06321 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06321 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06321 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06321 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06321 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06321 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06321 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06321 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06321 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06321 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06321 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P06321 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06321 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06321 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06321 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06321 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06321 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06321 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06321 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06321 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06321 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06321 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06321 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06321 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06321 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06321 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06321 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06321 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P06321 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06321 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06321 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06321 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P06321 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06321 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06321 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06321 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06321 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06321 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06321 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06321 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06321 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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