Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CrygdP04342 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CrygdP04342 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CrygdP04342 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CrygdP04342 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CrygdP04342 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CrygdP04342 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CrygdP04342 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CrygdP04342 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CrygdP04342 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CrygdP04342 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms