Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P04214 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P04214 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P04214 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17■□□□□ 0.31
P04214 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P04214 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P04214 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P04214 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P04214 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P04214 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P04214 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P04214 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P04214 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P04214 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P04214 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P04214 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P04214 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
P04214 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P04214 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P04214 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P04214 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P04214 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P04214 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
P04214 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P04214 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P04214 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P04214 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
P04214 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P04214 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P04214 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P04214 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P04214 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P04214 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P04214 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P04214 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P04214 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P04214 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P04214 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P04214 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P04214 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P04214 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P04214 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P04214 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P04214 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P04214 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P04214 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P04214 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P04214 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P04214 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P04214 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P04214 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P04214 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P04214 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P04214 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P04214 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P04214 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P04214 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P04214 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P04214 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P04214 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P04214 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P04214 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P04214 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P04214 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P04214 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P04214 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P04214 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P04214 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P04214 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P04214 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P04214 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P04214 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P04214 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P04214 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P04214 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P04214 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P04214 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P04214 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P04214 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P04214 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P04214 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P04214 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P04214 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P04214 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P04214 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P04214 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
P04214 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P04214 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
P04214 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
P04214 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
P04214 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P04214 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P04214 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P04214 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P04214 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P04214 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P04214 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P04214 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P04214 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P04214 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms