Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P04212 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P04212 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P04212 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P04212 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P04212 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P04212 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P04212 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P04212 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P04212 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P04212 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P04212 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P04212 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
P04212 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P04212 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P04212 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P04212 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P04212 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P04212 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P04212 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P04212 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P04212 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P04212 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P04212 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P04212 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P04212 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P04212 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
P04212 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P04212 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P04212 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P04212 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P04212 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P04212 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P04212 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P04212 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P04212 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P04212 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P04212 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P04212 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
P04212 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P04212 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P04212 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P04212 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P04212 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P04212 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P04212 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
P04212 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P04212 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P04212 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P04212 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P04212 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P04212 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P04212 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P04212 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P04212 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P04212 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P04212 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P04212 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
P04212 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P04212 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P04212 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P04212 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
P04212 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P04212 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P04212 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P04212 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P04212 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P04212 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P04212 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P04212 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P04212 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P04212 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P04212 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P04212 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P04212 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
P04212 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P04212 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P04212 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P04212 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P04212 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P04212 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P04212 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P04212 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
P04212 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P04212 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P04212 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P04212 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P04212 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P04212 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P04212 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P04212 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P04212 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P04212 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
P04212 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P04212 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P04212 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P04212 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P04212 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P04212 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P04212 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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