Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt1P04104 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt1P04104 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt1P04104 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt1P04104 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt1P04104 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms