Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01822 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01822 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01822 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01822 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01822 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01822 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01822 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01822 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01822 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01822 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01822 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01822 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01822 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01822 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01822 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01822 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01822 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01822 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01822 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01822 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01822 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01822 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01822 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01822 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01822 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01822 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01822 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01822 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01822 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01822 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01822 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01822 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01822 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01822 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01822 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01822 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01822 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01822 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01822 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01822 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01822 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01822 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01822 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01822 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01822 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01822 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01822 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01822 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01822 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01822 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01822 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01822 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01822 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01822 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01822 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01822 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01822 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01822 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01822 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01822 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01822 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01822 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01822 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01822 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01822 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01822 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01822 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01822 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01822 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01822 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01822 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01822 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01822 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01822 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01822 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01822 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01822 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01822 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01822 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01822 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01822 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01822 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01822 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01822 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01822 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01822 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01822 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01822 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01822 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01822 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01822 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01822 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01822 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01822 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01822 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01822 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01822 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01822 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01822 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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