Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01734 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01734 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01734 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01734 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01734 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01734 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01734 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01734 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01734 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01734 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01734 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01734 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01734 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01734 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01734 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01734 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01734 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01734 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01734 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01734 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01734 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01734 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01734 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01734 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
P01734 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01734 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01734 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01734 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01734 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01734 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01734 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01734 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01734 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01734 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01734 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01734 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01734 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01734 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01734 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01734 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01734 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01734 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01734 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01734 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01734 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01734 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01734 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01734 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01734 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01734 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
P01734 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01734 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01734 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01734 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01734 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01734 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01734 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01734 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01734 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01734 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01734 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01734 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01734 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01734 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01734 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01734 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01734 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01734 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01734 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01734 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01734 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01734 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
P01734 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01734 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01734 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01734 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
P01734 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01734 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01734 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01734 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01734 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01734 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01734 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01734 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01734 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01734 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01734 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01734 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01734 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01734 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01734 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01734 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01734 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01734 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01734 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01734 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01734 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01734 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
P01734 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms