Protein–RNA interactions for Protein: P01636

Ig kappa chain V-V region MOPC 149, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01636 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01636 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01636 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01636 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01636 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01636 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01636 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
P01636 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01636 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01636 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01636 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01636 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01636 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01636 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01636 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01636 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01636 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01636 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01636 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01636 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01636 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01636 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01636 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01636 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01636 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01636 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01636 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01636 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01636 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01636 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01636 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01636 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01636 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01636 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01636 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01636 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01636 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01636 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01636 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01636 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01636 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01636 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01636 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01636 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01636 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01636 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01636 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01636 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01636 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01636 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P01636 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P01636 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01636 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01636 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01636 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01636 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01636 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01636 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01636 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P01636 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01636 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01636 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01636 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P01636 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01636 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01636 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01636 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01636 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01636 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01636 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01636 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01636 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01636 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01636 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01636 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01636 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01636 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01636 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01636 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01636 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01636 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01636 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01636 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01636 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01636 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01636 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01636 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01636 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01636 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01636 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01636 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01636 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01636 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01636 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01636 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01636 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01636 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01636 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01636 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01636 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms