Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms