Protein–RNA interactions for Protein: O89032

Sh3pxd2a, SH3 and PX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3pxd2aO89032 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3pxd2aO89032 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3pxd2aO89032 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3pxd2aO89032 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3pxd2aO89032 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3pxd2aO89032 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3pxd2aO89032 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3pxd2aO89032 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3pxd2aO89032 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms