Protein–RNA interactions for Protein: O89020

Afm, Afamin, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AfmO89020 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AfmO89020 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AfmO89020 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AfmO89020 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AfmO89020 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AfmO89020 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AfmO89020 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AfmO89020 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AfmO89020 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AfmO89020 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AfmO89020 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AfmO89020 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AfmO89020 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
AfmO89020 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AfmO89020 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AfmO89020 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AfmO89020 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AfmO89020 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AfmO89020 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AfmO89020 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AfmO89020 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AfmO89020 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AfmO89020 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AfmO89020 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AfmO89020 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AfmO89020 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AfmO89020 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AfmO89020 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AfmO89020 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AfmO89020 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AfmO89020 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AfmO89020 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AfmO89020 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AfmO89020 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AfmO89020 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AfmO89020 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AfmO89020 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AfmO89020 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AfmO89020 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AfmO89020 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AfmO89020 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AfmO89020 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AfmO89020 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AfmO89020 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AfmO89020 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AfmO89020 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AfmO89020 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AfmO89020 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AfmO89020 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
AfmO89020 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AfmO89020 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AfmO89020 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AfmO89020 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AfmO89020 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AfmO89020 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AfmO89020 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AfmO89020 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AfmO89020 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AfmO89020 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AfmO89020 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AfmO89020 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AfmO89020 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AfmO89020 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AfmO89020 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AfmO89020 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AfmO89020 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AfmO89020 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AfmO89020 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AfmO89020 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AfmO89020 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AfmO89020 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AfmO89020 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AfmO89020 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AfmO89020 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AfmO89020 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AfmO89020 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AfmO89020 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AfmO89020 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AfmO89020 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AfmO89020 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AfmO89020 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AfmO89020 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AfmO89020 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AfmO89020 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
AfmO89020 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
AfmO89020 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AfmO89020 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AfmO89020 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AfmO89020 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AfmO89020 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AfmO89020 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AfmO89020 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AfmO89020 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AfmO89020 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AfmO89020 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AfmO89020 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AfmO89020 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AfmO89020 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AfmO89020 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AfmO89020 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms