Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms