Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnkO88874 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnkO88874 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CcnkO88874 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CcnkO88874 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcnkO88874 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CcnkO88874 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcnkO88874 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcnkO88874 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcnkO88874 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcnkO88874 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcnkO88874 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcnkO88874 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcnkO88874 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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