Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tom1O88746 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tom1O88746 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tom1O88746 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tom1O88746 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tom1O88746 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tom1O88746 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tom1O88746 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tom1O88746 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tom1O88746 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tom1O88746 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tom1O88746 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tom1O88746 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tom1O88746 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tom1O88746 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tom1O88746 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tom1O88746 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tom1O88746 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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