Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

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Length 779 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Hcn3O88705 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Hcn3O88705 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Hcn3O88705 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Hcn3O88705 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Hcn3O88705 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Hcn3O88705 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Hcn3O88705 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hcn3O88705 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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