Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BlmO88700 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BlmO88700 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BlmO88700 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
BlmO88700 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BlmO88700 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BlmO88700 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BlmO88700 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BlmO88700 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BlmO88700 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
BlmO88700 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BlmO88700 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BlmO88700 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BlmO88700 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BlmO88700 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BlmO88700 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BlmO88700 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BlmO88700 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BlmO88700 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BlmO88700 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
BlmO88700 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BlmO88700 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BlmO88700 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BlmO88700 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BlmO88700 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BlmO88700 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BlmO88700 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BlmO88700 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BlmO88700 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BlmO88700 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BlmO88700 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BlmO88700 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BlmO88700 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BlmO88700 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BlmO88700 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BlmO88700 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BlmO88700 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BlmO88700 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BlmO88700 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BlmO88700 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BlmO88700 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BlmO88700 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BlmO88700 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BlmO88700 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BlmO88700 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BlmO88700 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BlmO88700 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BlmO88700 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BlmO88700 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BlmO88700 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BlmO88700 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BlmO88700 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BlmO88700 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BlmO88700 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BlmO88700 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BlmO88700 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BlmO88700 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BlmO88700 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BlmO88700 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BlmO88700 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BlmO88700 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BlmO88700 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BlmO88700 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BlmO88700 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BlmO88700 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BlmO88700 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BlmO88700 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BlmO88700 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BlmO88700 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BlmO88700 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BlmO88700 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BlmO88700 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BlmO88700 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BlmO88700 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BlmO88700 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BlmO88700 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BlmO88700 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BlmO88700 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BlmO88700 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BlmO88700 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BlmO88700 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BlmO88700 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BlmO88700 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BlmO88700 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BlmO88700 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BlmO88700 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BlmO88700 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BlmO88700 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BlmO88700 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BlmO88700 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BlmO88700 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BlmO88700 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BlmO88700 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BlmO88700 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BlmO88700 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BlmO88700 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BlmO88700 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BlmO88700 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BlmO88700 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BlmO88700 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms