Protein–RNA interactions for Protein: O88544

Cops4, COP9 signalosome complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops4O88544 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops4O88544 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops4O88544 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops4O88544 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops4O88544 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops4O88544 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops4O88544 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops4O88544 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cops4O88544 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cops4O88544 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cops4O88544 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cops4O88544 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cops4O88544 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cops4O88544 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cops4O88544 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cops4O88544 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cops4O88544 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cops4O88544 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cops4O88544 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cops4O88544 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cops4O88544 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cops4O88544 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cops4O88544 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cops4O88544 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cops4O88544 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cops4O88544 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cops4O88544 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cops4O88544 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cops4O88544 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cops4O88544 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cops4O88544 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cops4O88544 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cops4O88544 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cops4O88544 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cops4O88544 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cops4O88544 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cops4O88544 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cops4O88544 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cops4O88544 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cops4O88544 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cops4O88544 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cops4O88544 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cops4O88544 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cops4O88544 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cops4O88544 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cops4O88544 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cops4O88544 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cops4O88544 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cops4O88544 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cops4O88544 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cops4O88544 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cops4O88544 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cops4O88544 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cops4O88544 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cops4O88544 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cops4O88544 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cops4O88544 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cops4O88544 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cops4O88544 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cops4O88544 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cops4O88544 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cops4O88544 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops4O88544 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops4O88544 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops4O88544 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cops4O88544 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops4O88544 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops4O88544 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops4O88544 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops4O88544 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cops4O88544 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cops4O88544 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops4O88544 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cops4O88544 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops4O88544 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops4O88544 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops4O88544 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops4O88544 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cops4O88544 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops4O88544 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops4O88544 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops4O88544 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops4O88544 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops4O88544 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops4O88544 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops4O88544 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops4O88544 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cops4O88544 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cops4O88544 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cops4O88544 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cops4O88544 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cops4O88544 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cops4O88544 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cops4O88544 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cops4O88544 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cops4O88544 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cops4O88544 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cops4O88544 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cops4O88544 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cops4O88544 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms