Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms