Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
AvilO88398 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AvilO88398 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AvilO88398 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AvilO88398 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AvilO88398 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AvilO88398 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AvilO88398 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AvilO88398 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AvilO88398 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AvilO88398 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AvilO88398 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AvilO88398 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AvilO88398 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AvilO88398 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AvilO88398 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AvilO88398 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AvilO88398 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AvilO88398 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AvilO88398 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AvilO88398 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AvilO88398 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
AvilO88398 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AvilO88398 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AvilO88398 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AvilO88398 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AvilO88398 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AvilO88398 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AvilO88398 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AvilO88398 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AvilO88398 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AvilO88398 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AvilO88398 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AvilO88398 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AvilO88398 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AvilO88398 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AvilO88398 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AvilO88398 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AvilO88398 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AvilO88398 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AvilO88398 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AvilO88398 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AvilO88398 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AvilO88398 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AvilO88398 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AvilO88398 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AvilO88398 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AvilO88398 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AvilO88398 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AvilO88398 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AvilO88398 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AvilO88398 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AvilO88398 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AvilO88398 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AvilO88398 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AvilO88398 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AvilO88398 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AvilO88398 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AvilO88398 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AvilO88398 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AvilO88398 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AvilO88398 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AvilO88398 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AvilO88398 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AvilO88398 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AvilO88398 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AvilO88398 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AvilO88398 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AvilO88398 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AvilO88398 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AvilO88398 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AvilO88398 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AvilO88398 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AvilO88398 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AvilO88398 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AvilO88398 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AvilO88398 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AvilO88398 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AvilO88398 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AvilO88398 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AvilO88398 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AvilO88398 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AvilO88398 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AvilO88398 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AvilO88398 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AvilO88398 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AvilO88398 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AvilO88398 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AvilO88398 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AvilO88398 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AvilO88398 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AvilO88398 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AvilO88398 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AvilO88398 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AvilO88398 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AvilO88398 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AvilO88398 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AvilO88398 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AvilO88398 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AvilO88398 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms