Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms