Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms