Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AurkbO70126 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AurkbO70126 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AurkbO70126 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AurkbO70126 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AurkbO70126 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AurkbO70126 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AurkbO70126 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AurkbO70126 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AurkbO70126 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AurkbO70126 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AurkbO70126 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AurkbO70126 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AurkbO70126 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AurkbO70126 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AurkbO70126 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AurkbO70126 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AurkbO70126 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AurkbO70126 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AurkbO70126 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AurkbO70126 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AurkbO70126 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkbO70126 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkbO70126 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkbO70126 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkbO70126 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AurkbO70126 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AurkbO70126 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms