Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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